微氣泡發生器的工作原理是利用散氣葉輪的高速旋轉在水中形成一個真空區，液面上的空氣通過輸氣管進入水中去填充并切割，微氣泡隨之產生，并螺旋型地上升到水面，空氣中的氧氣也隨著進入了水中。污水在上升的過程中與葉輪產生的微氣泡充分混合。由于氣水混合物和液體之間的不平衡，產生了一個垂直向上的浮力，將固體懸浮物帶到水面。上浮過程中，微氣泡會附著在懸浮物上，到達水面后固體懸浮物便依靠這些氣泡支撐維持在水面。